使用膳食补充剂的基本原则有两个：要有循证医学证据支持，即遵从相关医学指南或专家共识的建议；缺什么补什么，缺多少补多少，要评估膳食情况和特殊需要，不可过量也不可盲目滥用。理论上，在使用膳食补充剂之前，要咨询营养专业人员。
在膳食补充剂使用中普遍主张婴幼儿要补充维生素D。配方奶中已经添加维生素D，所以婴儿每天喝足量的配方奶并不需要额外补充维生素D；当婴儿满1周岁，开始饮用维生素D奶制品后,就不再需要补充额外的维生素D；早产儿或有其他健康问题的婴儿可能需要补充维生素和矿物质，请向医生咨询相关问题。
除维生素D外，婴幼儿还应该注意补铁。婴儿满6个月后，应首先添加强化铁的婴儿米粉、肉泥等。早产/低出生体重儿应从4周龄开始补铁，剂量为每日2mg/kg元素铁，直至1周岁。纯母乳喂养或以母乳喂养为主的足月儿从4月龄开始补铁，剂量为每日1mg/kg元素铁；人工喂养婴儿应采用铁强化配方奶。注意0-6月龄婴儿不需要补钙，他们可以从母乳或配方奶粉中获得充足的钙。