1.企业管理者认识不足
大部分中小企业对ERP的认识不足，不知道如何去建设ERP。不少的经营管理者在ERP的认识上也有着偏差，有的管理者认为只要实施了ERP系统就能给企业的发展带来动力，注入新的生机和活力，把ERP系统当做解决企业问题的灵丹妙药，这无疑会给企业的发展指向一个错误的方向。有的管理者甚至认为ERP系统没什么用处，企业规模小，业务流程简单，信息量小，只需要企业一小部分内部人员就能够轻松搞定，没有必要花费大量的时间金钱去搞ERP系统。有的管理者只是刻意的强调某个环节，忽略了对整体的影响，盲目的进行投资，不仅造成企业资金的浪费还会影响企业的正常运营。
2.企业内部管理制度的不完善
影响ERP系统在中小企业实施的主要原因之一就是不完善的企业内部管理制度。大部分中小企业内部管理混乱，一人多岗多人同岗，业务流程粗放无序，不能够及时处理信息，这样的管理现状根本无法和具有先进管理思想及有序业务流程的ERP系统相适应，ERP系统的功能也就无法得到正常发挥。另外，ERP的运行需要真实可靠且标准化的数据，如果企业的内部缺少严格的控制与监督，业务人员随意录入原始数据或未经授权的人员任意更改数据，必然会影响ERP系统运行的结果，提供错误信息，误导企业做出错误决策。
3.云南ERP软件选型不当
许多中小企业在决定实施ERP项目时，没有彻底的了解企业自身需求，对于软件产品与经营目标是否能相互适应等问题缺乏考虑。在ERP系统的选择上存在盲目性，要么重视价格的高低、要么重视功能的强弱，有的模仿其他企业的选择，实施之后才会发现选择的ERP系统要么功能不完善无法满足企业的基本需求，要么功能过于强大流程过于复杂不适应企业的需求，致使投资失败。