全自动旋风器净化气体量应与实际需要处量一致。选择全自动旋风器时，直径时应尽量小些；如果要求通过的风量较大，可采用若干个小直径的旋风器并联；如果处理气量与多管旋风除尘器相符，以选多管旋风器为宜。
全自动旋风器的入口风速要保持在18-23 m/s，低于18m/s时，其除尘效率将会下降；高于23m/s时，除尘效率提高不明显，但阻力损失增加，能耗增大。
选择全自动旋风器时，要根据实际工况条件，考虑阻力损失和结构形式，尽可能做到节省动力消耗，同时以便于维护管理。
全自动旋风器能捕集到的尘粒应等于或稍小被处理气体的粉尘粒度。当含尘气体温度很高时，要注意保温，避免水分在旋风器内凝结。假如粉尘不吸收水分，旋风器的工作温度要比露点温度高出30度左右。假如粉尘吸水性较强，旋风器的工作温度要比露点温度高出40-50度，以避免露点腐蚀。
全自动旋风器结构的密封要好，确保不漏风，尤其是负压操作，更应该注意卸料锁风装置的可靠性。针对易燃易爆特性粉尘，应设有防爆装置。防爆装置的通常做法是在入口管道上加一个安全防爆阀门。当粉尘浓度较小时，允许的含尘浓度与旋风除尘器的筒直径有关，即直径越大，允许含尘质量浓度也越大。