（1）血管因素 目前已知大约有80%～90%的面肌痉挛是由于面神经出脑干区存在血管压迫所致。血管因素中以小脑前下动脉及小脑后下动脉为主。另外迷路上动脉及其他变异的大动脉如椎动脉、基底动脉亦可能对面神经形成压迫导致面肌痉挛。单一静脉血管压迫面神经时亦可导致面肌痉挛，且上述血管可两者同时对面神经形成压迫。
（2）非血管因素 桥脑小脑角的非血管占位性病变，如肉芽肿、肿瘤和囊肿等因素亦可产生面肌痉挛。其原因可能是由于：①占位导致正常血管移位，移位的血管压迫面神经。②占位对面神经的直接压迫；③占位本身异常血管的影响如动静脉畸形、脑膜瘤、动脉瘤等。另外后颅窝的一些占位性病变也可导致面肌痉挛。如罕见的中间神经的雪旺氏细胞瘤压迫面神经导致的面肌痉挛。在年轻患者中，局部的蛛网膜增厚可能是产生面肌痉挛的主要原因之一，先天性蛛网膜囊肿偶可发生面肌痉挛。
（3）面神经出脑干区以外区域的面神经脱髓鞘病变，面神经与周围组织电气绝缘下降，面神经轴索极易受组织刺激而兴奋产生肌肉抽搐。
（4）遗传因素