一、消泡剂浑浊的问题
消泡剂不是以溶解的状态存在于体系中的，一般是悬浮在体系中，因此选用的疏水颗粒、硅油、疏水颗粒的用量和成色就至关重要，这样造成了消泡剂的性能千差万别，但是只要消泡效果好、抑泡时间长就没有多大问题。
二、消泡剂抑泡时间的问题
消泡剂中硅油的性质决定了消泡剂的抑泡时间。硅油含量的多少决定了消泡剂在体系中的使用时间长短。消泡剂粒径的大小决定了消泡剂的耐过滤性，粒径太大或者消泡剂搅拌不够充分都有可能导致消泡剂被过滤掉，污水处理中一般用的污水处理消泡剂就会经过很多次过滤，如果在过滤中将消泡剂过滤走，这样对消泡和抑泡都会产生影响。
三、消泡剂的失效问题
酸碱稳定性问题，如果消泡的耐酸碱性不好导致硅油分解，从而导致消泡剂失效;某些化学成分使硅油溶解到体系中，这样消泡剂不再有消泡的作用，而是作为一个表面活性剂存在体系中，体系的泡沫会比没加消泡剂的时候更多。
正确使用消泡剂可以起到事半功倍的效果，市场上的消泡剂种类繁多，常见的有发酵用消泡剂、污水处理消泡剂、有机硅消泡剂、纺织印染消泡剂、聚醚消泡剂等。所以根据行业选择合适的消泡剂，只有这样体现出来的效果才会更加的明显。