免疫荧光双标技术抗体选择上最好是要选择不同种类的最好是单抗，避免同属性的抗体与两个一体产生交叉反应如果有限制，而且没有准确说明，其实出现这种情况只能抱着去试试的心态。
免疫荧光双标技术抗体选择通过一些试剂的影响。抗体的品质高低最终还是需要通过实验结果来呈现的，但是在选择抗体之前我们并无法准确判断抗体的效果如何。无论什么品牌的，无论进口还是国产的，都会有用得不错的产品，也都会有做不出来的产品。抗体属于异质化产品，不同品牌之间但是基于仪器分析的一些实验，可能就会使用到直接标记的一抗，比如流式实验。那么需要了解到自己将要使用的仪器能检测到的荧光范围，针对不通的参数要求选择对应的标记物。在免疫荧光双标实验中，需要选配不同的荧光标记物。