HE染色的原料其实是苏木精染液这种溶液是属于碱性的，HE染色在实验过程中有一些细节的问题需要我们多多注意，那么现在就针对实验来谈谈HE染色实验过程。
HE染色实验首先将组织样本进行常规的石蜡包埋。在模具中加入液态石蜡，将待包埋的组织样本放入石蜡中，确保组织位置规整。补充少许液态的石蜡后，进行降温冷冻，使石蜡变为固态达到组织固定的效果，然后使用石蜡切片机进行切片。向上一步驟的组织样本切片中加入伊红染液，并使组织可以充分染色3min，染色完毕后，这样可以在进行染液染色的时候，染液可以充分进入组织种，同时，二甲苯还可以起到透明的作用，使切片更容易观察，再将组织切片进行梯度脱水。将脱水后的组织样本切片使用二甲苯浸泡２次，每次持续４min，然后将组织样本切片干，并使用中性树胶封片。