石蜡包埋是一种能够很好的用于观察正常细胞组织的形态以及结构，这个在病理学以及法医学等应用的比较多，能够很好的对细胞进行观察。我们人体的细胞和组织在没有HE染色或者石蜡切片等技术应用的时候，一般是比较难区分的，因为它的颜色以及形态都比较相似，所以石蜡包埋的应用就能更好的对细胞组织进行观察。
石蜡包埋的石蜡切片法包括取材、固定、洗涤和脱水、透明、浸蜡、包埋、切片与贴片、脱蜡、染色、脱水、透明、封片等步骤。一般的组织从取材固定到封片制成玻片标本需要数日，但标本可以长期保存使用，为永久性显微玻片标本。石蜡包埋的取材应该根据要求进行选择。比如植物细胞有丝分裂多选取洋葱根尖，细胞分裂快又便于切取；猪的肝小叶边界清晰明确；耳蜗以豚鼠的内耳易于定位和剥离。这里需要注意的是选材必须要新鲜，时间久了就容易变性，而且还会滋生细菌，没法准确的反应组织的形态结构。