随着科技的发展，组织块的石蜡包埋由简单的人工包埋转向用机器的半自动包埋。
石蜡包埋机包埋法：
1、 打开电源总开关，让包埋机处于工作状态。
2、 调高温度，让包埋蜡温至65度左右。
3、 打开冷冻台。
4、 取出包埋模型，由脚踩踏或手控出蜡制，注入少量的石蜡后，挟入组织块，小的多块组织应放在一起，大块组织应压平，管状和皮肤组织应竖起来包埋，然后再压上包埋盒，包埋盒上再注入少量石蜡，包埋完后，将其置于冷冻台上，旁边备有一盒冷水，当冷冻台上的包埋块表面出现凝结时，迅速将它放入水中，然后取出蜡块，修削去周边的余蜡，按顺序排列好于4°C冰箱或冰格中冻起来备用。
很多人质疑为什么石蜡包埋要用很旧反复用过的石蜡？一般来说石蜡刚出厂密度比较疏松，反复多次融化和冷却后，石蜡密度会增加，更贴近包埋组织的密度和硬度，在包埋组织时不易造成蜡块的脱裂。