肠溶胶囊是一种胶囊，只有在人身体的小肠里，才可以被吸收。肠溶胶囊就是将一种特别的药用高分子材料，经过特别的加工，只在肠道里分解，而不会溶解在胃液中。这种胶囊在胃部，在水中，甚至在开水中都不会融化。
肠溶胶囊需要在肠道内遇碱性液体才会溶化，而胃酸是酸性的，因此胶囊在胃里不会被溶化。如果肠溶胶囊在胃中溶化，反而有可能会对胃造成损伤。
现在临床上通常所见的胶囊是明胶胶囊，成分为明胶。药用明胶是选用动物皮、骨和筋腱，经复杂的理化处理制成的高级胶品，具有粘度高、冻力高、易凝冻等物理特点。
胃部和肠是人体的消化系统，胃部是酸性的，肠道是碱性的。因此根据这一部分，目前的胶囊通常分为两类，一类是在胃部溶解，一类是在肠道内溶解。
因为部分药物对胃部刺激比较强烈，会造成损害，但是不会对肠道造成损害。所以，这些药品，都是要使用肠溶胶囊的。