口腔CBCT主要应用于口腔医疗领域，是目前比较专业的一款影响扫描设备。口腔CBCT可用于种牙植牙、颌面外科、正畸、牙体牙髓病、牙周病等方面的检查。使用CBCT方便医生在治疗及手术前可获得完美、清晰、准确的术区立体影像，其可准确指导手术及治疗，提高手术及治疗的成功率，降低术后并发症的发生率。采用CBCT的检查，可以解决患者各个领域的牙科疾病治疗与排查，省钱、高效、清晰。
口腔CBCT与传统CT的区别在于CBCT用三维锥形束X线扫描，而传统CT用二维扇形束扫描。带来的结果是传统CT的投影数据是一维的，重建后形成二维图像数据，重组的三维图像是连续多个二维切片堆积而成的，因而图像金属伪影较重；而口腔CBCT的投影数据是二维的，重建后直接得到三维图像，伪影较轻。就这点方面的区别，可直接影响医生的判断和诊疗结果。