AKK菌是阿克曼菌的简称，是一种由荷兰生物学家发现并以他的名字命名的肠道细菌。
AKK菌是一种椭圆形的革兰氏阴性厌氧菌，正是因为厌氧的属性，使其在常规环境下不易培养，延缓了人类发现的进程。AKK菌是人体肠道的原生菌，约占人体微生物群落的3-5%。AKK菌以人体肠道粘膜中的黏蛋白为营养来源，因此AKK菌有一个很明显的特性，就是依附肠道黏膜而生。它通过竞争作用保护肠道免受病原体侵害。与其他肠道菌不同的是，AKK菌可以储备黏蛋白，即使在肠道中没有营养物质（特别是在禁食期间），也可以蓬勃地繁衍生息。除了利用黏蛋白作为能源供给，科学家们认为AKK菌也可能参与恢复肠道黏蛋白储备的机制，达到自给自足。
