手术室空气的洁净程度是按照含尘浓度来衡量的。含尘浓度越高则洁净度低，反之也成立。空气洁净手术室指空气洁净度不低于100 000级的手术室。据每立方米中粒径大于或等于0．5μm空气灰尘离子数的多少，洁净手术室可分100级、1 000级、10 000级、100 000级4种。以上数字越低，表明手术室净化级别越高。
手术室净化是由空气过滤器实现的，根据滤尘(菌)效率的大小将空气过器分为初效、中效、亚高效和高效4种。层流是洁净手术室实现去除灰尘、净化气的重要技术，洁净室层流形式主要有垂直层流和水平层流方式。层流式通风将空气由一侧全面地以均匀速度流至另一侧，使污染空气平推而出，通风时气流室中按整个横切面平推前进，故称层流式通风。
层流式通风送风量大，每小时最多换气600～700次。通风中使用过滤器的面积大，气流通过过滤器的流速较慢，但保持空气灭菌环境彻底。垂直层流换气次数多、手术室净化水平高，而水平层流易于改造或建造，应用较广泛。层流洁净手术室仅限于Ⅰ级(100级)手术室。